雷尼替丁常用于治疗消化性溃疡、返流性食道炎、急性胃黏膜出血、促胃泌素瘤、应急性溃疡和上消化道出血等。随着临床应用研究深入，发现一些新用途。
溃疡性结肠炎
雷尼替丁通过抑制胃酸的分泌，使患者Ts介导的免疫反应得到调整，从而缓解溃疡性结肠炎的症状。临床应用丹参片联合雷尼替丁治疗溃疡性结肠炎，口服丹参片6片，一日3次，雷尼替丁0.15g，一日2次，早、晚饭时服用，8周后改为维持量，每晚睡前服0.15g，维持8周，疗程为16周，有一定疗效。
疣状胃炎
疣状胃炎又称痘疹样胃炎、慢性糜烂性胃炎。近年研究发现其有癌变倾向，而引起广泛关注。其发病机制尚未完全明了，目前认为可能与Hp感染、胃酸过多、胆汁反流、变态反应及机械刺激等多种损害因素有关。临床应用雷尼替丁加硫糖铝治疗疣状胃炎，口服雷尼替丁胶囊0.3g，每晚睡前服；硫糖铝1g，一日3次，空腹嚼碎口服；多潘立酮10mg，一日3次，三餐前30min口服，疗程为4周。总有效率为90.0%。
非溃疡性消化不良
非溃疡性消化不良是一种功能性胃病，发病机制目前尚不完全清楚，临床研究表明，抑酸剂对NUD患者确有良好的疗效。应用雷尼替丁治疗非溃疡性消化不良，口服雷尼替丁0.15g，一日2次，疗程为2周，有一定疗效。
慢性腹泻
慢性腹泻是以细菌性痢疾为主的慢性疾病。应用枸橼酸铋雷尼替丁加左氧氟沙星治疗急性细菌性痢疾，口服枸橼酸铋雷尼替丁胶囊0.35g，一日2次，左氧氟沙星针0.2g，静滴，一日1次，疗程为5天。枸橼酸铋雷尼替丁既具有雷尼替丁的抑制胃酸、胃蛋白酶分泌的作用，又具有枸橼酸铋抗幽门螺旋杆菌和保护胃黏膜的作用，能与组织胺受体竞争，消除组织胺对肠黏膜的有害刺激，改善肠黏膜的水肿及毛细血管通透性，使炎症尽快消退，腹泻缓解。
