在胚胎的形成过程中，男方提供了一条精子，因此，男方原因是自然流产中不可忽视的因素。染色体异常、精子形态异常以及精子DNA完整性差，感染因素，血型不合等，是男性导致女性自然流产的常见原因。
染色体是遗传物质----基因的载体。夫妻双方染色体异常，导致胚胎染色体异常率增加。染色体异常是早期自然流产最常见的病因，约占50-60%。其发病率较高，我院不孕症门诊染色体异常率为2.11%，染色体多态性高达4.09%，男女发病率基本相同。47，XXY、inv(Y),Yqh+,Yqh-是男性性染色体异常中最常见类型。然而并不是所有的染色体异常都会引起流产风险的增加，只有部分染色体异常如平衡易位（多见罗伯逊易位），平衡易位等证实与流产相关。如果出现异常，目前是无法根治的，建议夫妇行遗传咨询后，可以选择供精或者通过胚胎植入前筛查（PGS）等方式来减少流产等方面的风险。
精子形态是反映男性生育力的重要指标，精子的受精能力是和精子的正常形态结构密切相关，正常形态结构的精子数量越多，生育力就越强。异常精子的形态常与感染、外伤、雄激素变化或化学药物及遗传因素影响有关。
研究报道，少精症、弱精症或畸精症患者非整倍体精子发生率增加，进而胚胎非整倍体发生率增加。少弱畸精症的治疗要明确病因，然后进行针对性治疗。精子DNA完整性检测反应了精子DNA的损伤程度，DNA碎片化对生育产生负面影响。其产生原因有疾病、药物和环境毒物引起精子发生过程中异染色质包装、睾丸局部温度增高引起低氧或氧自由基的形成和年龄、吸烟及环境污染导致凋亡异常。口服抗氧化剂（VC、VE、左卡尼丁等）可以降低精子DNA碎片化程度。
男性生殖道感染可以影响精子生成与排出，感染女方并影响胚胎发育。检测项目有支原体、衣原体、艾滋病、梅毒、淋球菌和TORCH检查。明确感染因素的病因进行针对性治疗。
母婴血型不合主要是指ABO血型不合或RH血型不合，可导致自然流产，因此夫妻双方需要检查血型。常发生在孕妇为0型，丈夫为A型、B型或AB型；或孕妇为RH阴性，丈夫为RH阳性时。母婴血型不合主要威胁胎儿的生命，对孕母有时因胎盘过大可引起产后出血，应予预防。
有15-30%的妊娠因各种原因而导致自然流产，这给渴望做妈妈的女性及其家庭带来了巨大的身心痛苦。通过检查明确致病原因，然后进行针对性治疗，可以有效降低自然流产的再次发生。
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